土豆的施肥主要以有機肥為主要使用肥料，可以適當地使用一些化肥，重施基肥，早施追肥，這就是土豆的用肥原則，因為有機肥里面富含有機物可以疏松土壤，提高土壤的肥力，可以配合使用一些微生物菌劑來使用，微生物可以讓有機肥充分腐熟，以此來提高土壤的肥力。

微生物菌劑中有益微生物能產生糖類物質，與植物粘液、礦物胚體和有機膠體結合在一起，可以改善土壤團粒結構，有效打破土壤板結。微生物菌劑還可以促進團粒結構的形成，并能改善土壤的通氣狀況，促進有機質、腐殖酸和腐殖質的生成。

微生物菌劑的微生物，例如抗生性微生物，它們能夠分泌抗生素，抑制病原微生物的繁殖，這樣就可以防治和減少土壤中土傳病害微生物對作物的危害，提高土豆產量和品質。微生物菌劑還可以對土壤進行“解毒”和“保健”，調控和維護土壤的健康質量。

微生物菌劑還具有解磷、解鉀、固氮的作用，促進土壤中微量元素的釋放及螯合，可提高肥料利用率10％～30％。在一定的條件下，還能參與腐殖質形成，有利于提高土壤肥力。